Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HOXB9P17482 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms