Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB4P16144 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB4P16144 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms