Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCL2P13500 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCL2P13500 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms