Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A1P11836 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms