Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DMDP11532 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DMDP11532 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DMDP11532 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DMDP11532 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DMDP11532 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DMDP11532 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DMDP11532 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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