Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHGAP10645 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHGAP10645 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHGAP10645 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHGAP10645 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms