Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM225BP0DP42 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms