Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FAM200BP0CF97 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms