Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SBK2P0C263 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms