Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CYC1P08574 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CYC1P08574 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYC1P08574 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms