Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
APOC1P02654 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms