Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MAP4K4O95819 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms