Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1AO95602 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1AO95602 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms