Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PPFIA3O75145 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PPFIA3O75145 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms