Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRAMEF2O60811 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms