Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CXCL13O43927 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CXCL13O43927 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms