Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATP9BO43861 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms