Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SYNGR3O43761 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms