Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TLX3O43711 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TLX3O43711 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TLX3O43711 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TLX3O43711 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms