Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LAMA5O15230 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LAMA5O15230 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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