Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PHOX2AO14813 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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PHOX2AO14813 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PHOX2AO14813 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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