Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RGPD8O14715 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RGPD8O14715 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms