Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms