Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms