Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
USP17L12C9JPN9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
USP17L12C9JPN9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms