Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVV-2B6SEH9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms