Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SOBPA7XYQ1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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