Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L4A6NEF3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms