Protein–RNA interactions for Protein: A4QMS7

C5orf49, Uncharacterized protein C5orf49, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf49A4QMS7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C5orf49A4QMS7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms