Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ZNF330Q9Y3S2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms