Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMED5Q9Y3A6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms