Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERGIC3Q9Y282 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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ERGIC3Q9Y282 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERGIC3Q9Y282 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERGIC3Q9Y282 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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ERGIC3Q9Y282 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ERGIC3Q9Y282 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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