Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RCE1Q9Y256 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RCE1Q9Y256 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms