Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 APOBEC3H-201ENST00000348946 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SMIM11A-201ENST00000399292 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LHX6Q9UPM6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms