Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ATPIF1Q9UII2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms