Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN11AQ9UI33 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCN11AQ9UI33 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms