Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms