Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL9Q9P2J3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms