Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PHRF1Q9P1Y6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHRF1Q9P1Y6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms