Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4Q9P0V3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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