Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KCMF1Q9P0J7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KCMF1Q9P0J7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms