Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RDH8Q9NYR8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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