Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL28Q9NXS3 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms