Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATG3Q9NT62 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATG3Q9NT62 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms