Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TREX1Q9NSU2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1342.2 ms