Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PNPLA3Q9NST1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms