Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SALL1Q9NSC2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms