Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LHX5Q9H2C1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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