Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM31Q9BZY9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms