Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC32Q9BV29 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms